东涌教育指导中心是区教育局的外派机构，属区教育局和镇委、镇政府的下属单位，接受区教育局和镇委镇政府的双重管理，主要负责全镇中小学、幼儿园、成校、民办学校等教育机构的管理与督导，具体有：贯彻执行党和国家关于教育工作的方针、政策和法规，研究制定全镇教育发展战略，规划指导实施。领导、管理全镇的普通教育、幼儿教育、职业教育、成人教育、民办教育。指导管理教育系统的队伍建设、师资培训、职称评定、人事管理、财务管理、招生考试、督导评估、教育教研、电化教育、技术装备、基建初审、卫生保健、党建工作、群团组织、综合治理、信访安全、监察审计、青少年校外活动等工作。